肛周脓肿引流以后几乎大多数都会形成肛瘘，因此手术非常必要，但也存在个例，比如婴幼儿也会出现肛门周围感染，形成小脓肿，脓肿经过引流以后，因为小儿愈合非常快，自愈几率比较高。建议对于小儿肛瘘手术要高度谨慎，即脓肿引流后所形成的结节和硬结，如果不是反复发作，则无需着急进行手术。
小儿手术一般放在五岁以后，若期间反复发作、反复感染，可以考虑做手术，但因为存在自愈的可能，因此只要不是反复发作的脓肿，可能脓肿切开后一次即可治愈，再也不会发作。此类脓肿不一定形成肛瘘，但属于在肛周脓肿切开引流后极为特殊的情况。
