肛周脓肿多通过肛肠科医生指诊判断。进行处理前，还需进行多项检查明确，包括血常规检查，脓肿患者常出现白细胞及中性粒细胞升高；肛管直肠彩超，可直观判断和评估肛管脓肿的范围及走行，指导医生手术。手术中可取脓液进行细菌培养，明确细菌类型，指导临床用药；对腐坏组织进行病理检查，病理检查为诊断的金标准，可帮助疾病的诊断及预后。