患过脑炎的部分病人可能会有一定的智力障碍，脑炎是由感染、免疫等因素导致的神经系统，或者脑组织、脑细胞的炎症反应，其会导致脑细胞损伤，所以部分病人在脑炎急性期可能会出现精神障碍和认知行为障碍，或者出现癫痫发作，或者出现意识障碍等表现。
在脑炎恢复期，患者智能、认知、精神行为异常或者癫痫发作等表现，可能会逐渐得到缓解。大部分病人可能会随着时间延长和康复治疗的进行，脑炎相关的临床表现会逐渐消失，所以大部分病人预后良好。
但是部分病人可能会出现相关的认知、智能障碍，成年人的修复相对困难。小儿的修复和预后会更好，虽然其患过脑炎，但是随着年龄增加，可能对其智能没有过大的影响。
