无痛胃镜的检查时间与普通胃镜相同，只是无痛胃镜需要麻醉。通常检查时间是10-15分钟，但是一定要将食管、十二指肠均观察清楚，每一个典型部位均需要留图，可疑部位则需要病理活检，为快速尿素酶试验取材。因此根据上述要求，最少需要7分钟，10-15分钟比较好，但是过长时间会延长病人的痛苦。
无痛胃镜在操作之前需要静脉注射麻醉药，使病人处于麻醉状态，而且没有恶心反应，医生操作更加从容，注入气体能够很快将胃撑开，所以观察更快、更安全。因为胃腔、食管腔粗大，镜子＜1cm，在直视下边进镜、边观察，通常在有经验的医生操作下不会发生穿孔等意外。
