疫情期间儿童发烧是否会被隔离，主要取决于儿童是否存在新型冠状病毒肺炎接触史，具体如下：

1、如果儿童存在与新型冠状病毒肺炎患者，或者无症状感染者密切接触史，或者来自新型冠状病毒肺炎高、中风险地区。一旦出现发热，要进行新型冠状病毒肺炎四项排查，分别为血常规、肺CT、新型冠状病毒肺炎核酸和抗体，根据四项检查排查是否存在新型冠状病毒肺炎可能。如果存在新型冠状病毒肺炎可能，或者属于一代密切接触者、二代密切接触者，需要隔离进行观察治疗；

2、如果儿童疫情期间出现发烧，但是与新型冠状病毒肺炎患者或者无症状感染者没有任何接触。也不是来自于高、中风险地区，只需要正常进行新型冠状病毒肺炎核酸筛查。如果检测为阴性，按照普通感染性疾病，进行处理即可，不需要给予隔离观察治疗。