肝囊肿治疗费用需视具体情况而定，若囊肿较小、无症状，无需治疗，仅随访过程中产生复查费用。若囊肿较大需手术治疗，费用与病变情况、手术医院、手术方法有关，若为单纯性肝囊肿，仅需穿刺或开窗引流，费用较低；若肝囊肿病变较为严重，需行肝移植手术，则费用可达十万、数十万不等。若产生术后并发症，则总体花费相应增加。