先天性肝囊肿小且无症状者无需手术，囊肿较大且合并有症状者可考虑手术。有学者认为先天性肝囊肿5cm以上为手术指征，但是否手术行根据患者有无并发症及囊肿性质决定：

1、若囊肿较小但性质不明，无法排除肿瘤性病变可能，仍需考虑手术治疗；

2、若肝囊肿＞5cm，但患者无临床症状，且确切诊断为单纯性肝囊肿，可不考虑手术治疗。