机体碘缺乏，最常见的就是地方性甲状腺肿伴甲状腺功能减退症，这是由于这些地区远离海边，食物中含有的碘成分较少，而碘又是合成甲状腺激素的主要原料，如果碘缺乏就可能会导致甲状腺代偿性的增大，而甲状腺代偿性的增大超过一定标准，就可以产生甲状腺的肿大，即大脖子病。

现在这种情况已经很少见，因为现在的盐一般都有碘剂，不会造成碘缺乏，发生碘缺乏时，甲状腺激素合成分泌减少，需要查甲状腺激素的水平，如果甲状腺肿大，又伴有甲状腺功能减退症，那么有可能是碘缺乏导致的甲状腺功能减退症，应给予左甲状腺激素替代治疗。

机体内的碘绝大多数都是由甲状腺上皮细胞所摄取，在甲状腺细胞内进行碘化络氨酸，所以机体如果缺碘，主要是对甲状腺激素的合成产生影响，对其他的脏器一般不会产生影响，甲状腺激素的合成主要是在甲状腺内进行，所以当碘缺乏时，甲状腺组织就会代偿性增大，造成甲状腺组织的肿大。