乙型肝炎病毒相关性肾炎的预后与肾脏损害程度和肝脏损害程度有关，具体情况如下：

1、肝脏损害较重，引起乙肝相关性肝硬化，即使肾脏损害轻微，预后也较差；

2、肝脏损害轻微，无肝硬化，肾脏损害轻微，具有自限性，预后较好；

3、肝脏损害轻微，肾脏损害较重，治疗效果差，短期内可进展到慢性肾衰竭，甚至尿毒症，预后较差。