胃间质瘤起源于胃肠道未定向分化的间质细胞，是不同于胃癌的另一种恶性肿瘤。胃间质瘤的恶性程度取决于肿瘤细胞的核分裂象和肿瘤大小。肿瘤越小，核分裂象越低，则恶性程度越低，治疗效果越好。低度恶性或者中度恶性的胃间质瘤，通过手术治疗可以治愈；高度恶性的胃间质瘤，则需要手术联合靶向治疗。总体来说，胃间质瘤相对于胃癌治疗效果更好。