脑钙化的最严重后果是钙化物质引起脑组织症状，脑钙化会造成钙化部位的相应症状，如发生在小脑的钙化会引起平衡异常，发生在功能区的纤维钙化会引起肢体麻木、无力等。但脑部钙化有很多是生理性钙化，如松果体钙化、脑室脉络丛钙化、苍白球钙化，随着年龄增加，上述脑钙化可以发生在正常人。
脑钙化的常见原因是甲状旁腺激素异常，无论是甲状旁腺激素亢进或减低，均会导致脑钙化。如果脑钙化出现在脑部表面，存在点状钙化，此时需警惕脑部发生是否血管畸形，如果有上述情况，一定要及时筛查，避免脑血管畸形、出血，而危及生命。所以脑钙化的后果主要取决于钙化原因，如果脑钙化是发生在脑部实质的局灶组织，需警惕此时是否有肿瘤、占位性病变。
