阴茎延长手术若严格按照操作规程进行，不会引起严重后遗症。但如果操作不规范，手术中损伤阴茎海绵体的血管、神经，可能导致局部感染、血管神经受损、勃起功能障碍等并发症。
延长手术属于整形美容手术，要求非常高，因为手术是在正常人的身体上进行，且涉及阴茎部位。因此进行此类手术需谨慎。
首先并非所有人都需要做手术。绝大多数寻求此手术的人，其实阴茎本身就是正常的。如果觉得阴茎较短或较小，首先要心理放松，因为阴茎没有绝对的长短粗细标准，可能相较于他人稍短或稍小，但这并不影响生活质量。应以心理放松为主。
如果确实有手术需求，务必到正规医院进行。因为这个手术涉及阴茎部位，操作不规范可能导致局部感染、效果不理想或血管神经损伤，进而影响性功能。
