胃肠道间质瘤的检查方法如下：

1、向胃腔内或肠腔内突出的胃肠道间质瘤：为主要的胃肠道间质瘤类型，通过胃镜检查与肠镜检查，可观察胃黏膜或肠黏膜的突起。肿瘤发展至2-3公分时，处于恶性与良性的交界，发展至3公分时，患者常表现为因出血导致的贫血症状；

2、向腹腔内生长的胃肠道间质瘤：一般无法通过胃镜检出病灶，可通过CT检查观察肠壁外的生长。