减重代谢手术的副作用与其他腹部手术类似，具体如下：

1、出血：术后最为常见的并发症，患者早期可能出血，甚至出现消化道大量出血症状；

2、消化道瘘：包括胃瘘、空肠瘘、吻合口瘘等；

3、远期并发症：包括营养不良、甲状旁腺功能亢进、内疝、肠梗阻等；

4、反弹：进行减重手术后，如患者依从性较差，可能导致体重反弹。