子宫内膜异位症，主要表现是痛经，有时需吃止疼药，甚至注射止痛针，可造成不孕。如果内膜病变位于宫颈的后方，会出现性交痛。此外，病人会出现月经异常，月经改变。有时会出现较罕见症状，如有活性的子宫内膜细胞，经血液到达肺部停留，则在出现月经期间出现咳血症状；侵犯到直肠，出现周期性便血；如侵犯到膀胱，出现周期性尿血的症状。