肺孢子菌丝病的治疗方式如下：

1、使用抗真菌药物治疗，如卡泊芬净；

2、使用磺胺类药物治疗，该类药物为一线首选药，如复方磺胺甲基异恶唑。使用时需保证用量足够大，比例为每公斤体重每天需100mg药物，每片药约为0.49g，即患者需每次吃四片，一日三次，以保证用量。该类药使用疗程较长，一般不少于三星期；

3、患者病情较重，有明显发烧时，需用皮质激素，减少局部渗出和中毒症状。

具体用药请结合临床，由医生面诊指导为准。