贲门癌早期的时候不会产生疼痛，患者没有明显症状，但是随着疾病的发展，患者会出现上腹部疼痛，即肚脐以上和剑突以下的部位存在隐隐约约的疼痛。开始是轻微的阵发性疼痛，随着疾病的发展，疼痛时间可能会逐渐延长，同时疼痛发作的间隔时间可能会越来越短。
若发展到疾病晚期，可能疼痛由阵发性疼痛变为持续性疼痛。如果肿瘤出现在贲门后壁，侵犯到后腹膜或者腹腔，或者腹膜后淋巴结肿大或者转移的时候，患者还会出现背部疼痛。疼痛初期可能同样程度较轻，且往往是阵发性，但随着疾病的发展，疼痛程度可能会加重，阵发时间可能越来越频繁。因此发展到特别晚的时期，可能疼痛变为持续性疼痛，疼痛程度也会加重。
