内镜下黏膜下层剥离术的并发症有：

1、遇到黏膜下层血管比较大，出血量比较明显，影响操作视野时，有可能终止操作，但随着现在设备清晰度和精细度的提高，该事件发生率逐渐减小；

2、比较严重的是穿孔，但并不可怕，现在缝合技术，包括止血夹、荷包缝合，还有比较新、价格较贵的新技术，对于创口的缝合比较成功，成功率较高。同时如有必要可中转到外科手术，是补救措施。