枕神经痛主要和偏头疼鉴别。偏头疼也叫血管神经性头疼，头疼时候血管搏动或者有血管搏动感，疼痛也比较剧烈，部分患者疼痛比较轻，病人伴有其他症状，像血压高或者睡眠不好等。枕神经痛是触电样疼痛，不敢去碰局部，稍微一碰局部，会出现触电样感觉，并且就像过电样疼。偏头疼一般在患者头一侧，而且疼痛部位根据枕大、枕小、耳大神经根据解剖部位不同而不一样，很少有两个枕大、枕小同时发生疼痛情况。
根据疼痛性质、疼痛部位、疼痛伴随症状，可以鉴别。治疗上中医都是以局部治疗和整体治疗为主，相互配合。血管神经性头痛和枕神经痛局部治疗都一样，采用压痛点疗法。老百姓都知道通则不痛，不痛则通。整体治疗血管性头痛，大部分中医认为肝阳上亢引起来，治疗采取平肝潜阳、通经活络方法，常用肝经穴位太冲，大肠经穴位合谷，曲池等穴位治疗。枕神经痛根据《黄帝内经》中诸痛痒疮，皆属于心，采取祛心火方法，在心经循行部位找到瘀络，可以局部点刺、放血，再一个是用局部穴位，五腧穴采用荥穴治疗，祛心火。