儿童根尖脓肿一般自愈的可能性不大，但如果是对非常小的脓肿，且有相应的排脓通道，就有自愈的极小可能性。但是对于儿童根尖脓肿，一般还是应该引起高度重视。虽然不同于成人的根尖脓肿，但最好建议还是要进行相应的治疗，因为有可能会引起口腔感染，引起骨质破坏等。
对于儿童根尖脓肿，一般先要进行仔细检查，进行精准定位，将导致儿童根尖脓肿的病因找到。找到相应的病因以后，根据病因给予相应的诊治，并根据儿童根尖脓肿的大小、范围，进行相应的牙片检查以及相应的口腔咬合检查等。
通过这些检查以后，就能够基本将根尖脓肿的位置进行精准定位，然后再进行相应的治疗。对于牙源性的，则要进行牙体牙髓的治疗等。
