石蜡切片属较经济、稳定的制片方法，可长久保存，临床上多选用H-E染色，即使用苏木素进行细胞核染色，伊红对细胞浆及细胞外其他沉积物进行染色。优点在于病理医生可直接通过显微镜下观察做出判断，找到可疑病变；缺点在于此结果只可提示形态改变，且等待结果时间较长，如改用冰冻切片则病变细胞形态失真，不利于病理科医生进行诊断。