打溶栓针最主要的危害是出血。正常人体内凝血和抗凝是一个动态平衡的过程，出现急性血栓的时候，将溶栓药物注入到体内，药物不但能够作用在血栓上使血栓消融。
溶栓药物同时还会分布到身体的其他部位，如脑组织、消化道、泌尿系统等，会打破内部的凝血和抗凝作用平衡，增加出血的风险。
所以在溶栓之前，需要对患者做一个全面评估，判断有没有出血的危险因素，如近期有过大面积脑梗塞，或者有过头外伤病史，或者近期做过比较大的外科手术，或者有活动性消化道溃疡，如胃溃疡或者是十二指肠溃疡等。如果有，可能就不能进行溶栓。如果患者病情比较危重，血栓不溶栓或者不取出来会导致患者死亡或者致残。
此时可能会采取介入治疗方法进行取栓治疗，或者使用导管直接把溶栓药物注入到血栓部位，能够大大减少溶栓药物的用量，从而降低出血的风险。而且因为溶栓药物能够直接作用在血栓上，也能够保证溶栓的疗效。
