小男孩的尿痛，主要有以下几种原因，首先是包皮炎，然后泌尿系感染以及结石，也可以引起尿痛，具体情况如下：

1、包皮炎：其作为最常见的小男孩尿痛原因，主要是因为小男孩的包皮包裹阴茎头，称之为生理性的包茎。部分小男孩因为包皮口过于狭窄，排尿时尿液存留在包皮和阴茎头之间的腔隙内，即父母在门诊常说的排尿鼓包现象。这样久而久之，尿液中的污渍就残留在包皮腔隙内，形成包皮垢，引起周围局部组织的感染，再加上尿液的刺激，就可以引起疼痛。对于这种急性包皮炎的情况，需要做的是抗感染治疗，并且请专业的医生去教会家长上翻包皮，保持局部的清洁，防止再次感染的发生；

2、泌尿系感染：对于存在泌尿道感染的小男孩，由于炎症刺激尿道，也会引起局部排尿的疼痛。一般情况下，小男孩的尿道较长，很少出现泌尿系感染的情况。但是在合并输尿管反流、尿道瓣膜、膀胱功能障碍等情况下，也可能会出现泌尿系感染。家长需要做的就是带尿道瓣膜到专业的小儿泌尿外科就诊，明确病因；

3、泌尿系结石：而对于喝水较少，甚至是高尿酸、高草酸血症的尿道瓣膜，可能出现泌尿系结石的情况。如果结石存在于膀胱，刺激膀胱壁，或者较少、较小，以及泥沙样的结石存在尿道，也可以出现排尿疼痛的情况。对于此类情况，家长需要根据以上情况去对照，找出尿道瓣膜尿痛的原因，必要时可以请医生帮助治疗。