超声介入穿刺作为一种临床微创手术，如同其它手术或临床治疗一样，不可避免有一定不良反应和并发症，从时间上又分为近期和远期不良反应和并发症。第一种近期不良反应和并发症又分为：

1、疼痛：穿刺术中、术后最常见的不良反应，以穿刺局部轻微疼痛为主，主要发生在术后48小时内，疼痛轻微者不需要做特殊处理，疼痛剧烈者应当警惕出血或并发炎症；

2、发热：多数为37.5℃左右的低热，如果超过38.5℃需要对症处理，并注意排除有无合并感染，必要时进行血常规、血培养检查，对症处理无效时有明确的感染证据者，需要使用抗生素；

3、出血：发生率与所涉及的脏器、病灶内容、病灶性质、使用针具类型和外径、操作人员的熟练程度有关；

4、感染：超声介入穿刺并发感染的几率很小，引起术后感染的主要原因是介入器械、细菌污染和操作不规范，严格器械灭菌和无菌操作是预防感染的最有效途径。

超声介入穿刺远期的副作用和并发症包括：

1、血管狭窄；

2、胆道狭窄；

3、器官功能不全；

4、肿瘤种植。