肝内胆管结石能不能治好根据疾病情况确定。过去很难治好，或者很难除根。在过去很多肝内胆管结石反复做手术，有些人腹部做过6-7次手术，肚子上全是疤。当然现在技术、设备进步，比如现在有各种款式胆道镜、碎石机器，还有微创手段，提高胆石症的治愈率。要想尽可能的达到治愈目的，要遵循黄志强院士的四个基本原则，取净结石，尽可能取干净；解除胆管狭窄，让胆汁排空，使胆道通畅；还要把病损肝段切除掉。
很多病人每个管道里，每个角落里都是石头，非常难以根治、除根，就像掏耳朵一样，不可能把耳膜都掏碎，从而将耳朵掏干净。这种病人就比较麻烦，可能会经常需要做手术，反复做手术。但是现在微创技术发展很好，技术掌握很好，所以建议大家尽量可能采取微创手段，避免反复开刀，因为这次开刀后，可能过不久又长石头，又得再开一刀，很遭罪。如果能够通过微创手段解决，即使反复做手术，遭受痛苦会小很多。
