NT-proBNP主要用于检查患者是否存在心衰。如果患者因喘息、呼吸困难就诊，需要判断是心源性还是肺源性，因为心脏和肺部病变，都容易出现呼吸困难，此时可以通过NT-proBNP检测进行鉴别。如果测定NT-proBNP水平＜450pg/ml，基本可以排除心源性的呼吸困难，考虑是呼吸道的问题。如慢性阻塞性肺疾病的急性发作、支气管哮喘等。
如果NT-proBNP的水平明显升高，通常支持患者存在心功能不全，喘息是由心衰所致。心衰时由于无法将血液射入主动脉，导致血液淤积在心脏，然后到达肺部，引起肺静脉压、肺毛细血管压升高，甚至肺动脉的高压。肺部压力升高后，导致肺部血液增多，造成渗出而引起肺水肿，出现呼吸困难。所以NT-proBNP作为鉴别呼吸困难的指标，具有较大的临床价值。
