心导管手术实际是介入手术，目的只是作为很多复杂先心病，包括后心病，进行的诊断指标，通过外周血管把导管顺着血流飘到心房、心室、肺动脉，在各个层面上测定压力，仅采少量血测量血氧，然后综合计算心脏压力、心脏血氧含量、心脏阻力、肺动脉压力，主要是作为诊断用，一般30分钟，最多1个小时可以完成。

正常情况下心导管手术是局麻下进行，不会有严重的意外情况。但有两种顾虑，一是导管，若之前不规范使用，治疗时可能重复使用导管，因为一根导管很贵，若重复用可以节省钱，但是这不规范的，现在也不允许。重复使用导管断在血管然后飘到心脏里、飘到肺动脉里，就变成一个异物，久而久之合并感染较麻烦，而且取出来也很困难，要外科切开胸切除。若掉在外周血管飘到动脉如下肢动脉里，得把动脉切开取出或用抓捕器取，若取不出来很麻烦。掉到冠状动脉里造成冠状动脉梗塞、心梗，若掉到脑动脉里变成脑卒中、脑缺血。导管断裂是个大问题，崭新的导管若出现问题是厂家问题。

另一个重大问题是心律失常，因为导管飘到心脏里面，可能会对患者的心内膜擦、碰，若心脏应激性很高的患者可能会出现早搏，甚至出现较严重的心律失常。