肛周脓肿根治术和引流术的区别，在于引流术复发率相对较高，70%左右的患者会形成肛瘘，需要二次手术。根治术如果后期通过换药，基本上达到可以根治的效果，一期治愈。所以两个手术在于内口是否处理，内口原发灶是否得到彻底清除。具体如下：

1、目的不同：根治术顾名思义是尽量一次性根治，减少疾病的复发率。而引流术就是简单地切开引流，达到减压减痛、快速缓解症状的目的；

2、手术方式不同：肛周脓肿根治术多数是基于有明确内口的情况下，如明确有感染灶占据肛腺，可以进行根治性切除，让原发灶彻底地清除治愈，不至于形成肛瘘，减少二次手术的情况。引流术主要是对体质虚弱，或者合并血液病、艾滋病等特殊的疾病简单处理，或者患者的诉求，因为没有时间住院，简单需要切开引流即可。切开引流对内口不作处理，是把脓腔的脓液、坏死组织清除干净，然后填塞引流条，定期换药冲洗即可。