胃间质瘤来自于间叶组织，从病理类型上属于梭形细胞肿瘤，而从免疫组化上，表现为CD34，或者DOG1阳性，它既不是良性肿瘤，也不是恶性肿瘤，它是交界性的肿瘤。
胃间质瘤根据肿瘤的大小和核分裂象的多少，分为以下5级，包括极低危、低危、中危、高危和极高危，如果胃间质瘤切下来以后，化验结果是极低危，或者低危，也就是肿瘤大小＜1cm，核分裂象<5，此时切除以后进行定期复查即可。
如果肿瘤＞5cm，核分裂象＞5，就变成了中危，而核分裂象＞10，肿瘤＞10cm，就是极高危，这种手术切除以后有复发和转移的风险，因此这种胃间质瘤要进行术后的辅助治疗，现在是口服靶向药物甲磺酸伊马替尼片治疗。
