移植后存在咖啡色分泌物通常是指胚胎移植，主要包括以下几种原因：

1、移植摩擦腔道：若为刚移植，如今天或昨天才移植，此时存在少许咖啡色分泌物不必担心，可能是进行移植的操作过程，由于移植管摩擦腔道，如宫颈或子宫内膜的上皮细胞造成少许出血，通常问题较小；

2、胚胎着床：移植1周左右，出现少许点点滴状的咖啡色分泌物，此时可能是胚胎正在着床。胚胎进入子宫内膜的过程中，可能存在少许出血，此时称为着床期出血，也无需过于担心；

3、先兆流产：若已查血确定妊娠，此时仍存在咖啡色分泌物，应考虑是否为先兆流产，此时建议病人必要时可以做B超检查。若未到做B超的时间，可以定期监测HCG，观察其翻倍的情况，必要时采取黄体支持药物进行保胎处理；

4、自身疾病因素：女性可能本身存在宫颈糜烂或宫颈病变，此时可能是由于阴道或宫颈问题导致出血。

出现出血应先结合出血时间，并观察是否存在既往的病史，再进行判断，如果不好判断，建议到生殖中心就诊找医生进行评估。