进行双眼皮手术之后两边不一样，可能由于不同的原因导致，并采取不同的方式进行处理，具体如下：

1、肿胀因素：双眼皮手术后两边眼睛不同可能由早期肿胀引起，是由于双眼皮手术需要进行两侧的手术治疗，而部分医生喜欢先完成一侧再做另外一侧，或者两侧麻药量不同，都可能引起眼睛的肿胀，这时等待肿胀消退以后可以基本恢复；

2、技术因素：如果眼睛肿胀由于医生技术的问题，术前设计的两边宽窄不同，或者手术过程中两边去皮程度不同，两边固定的高低不同，都可能导致两侧不一样，需要等肿胀消退以后考虑进行二次的修复手术进行解决。