扁桃体肥大一般是由慢性扁桃体炎存在导致，这种情况用药并没有确切疗效，包括任何药。所以这种情况不建议用药，用药反而有潜在的相关风险、副作用，所以不建议使用任何药物治疗扁桃体肥大。
如果扁桃体肥大导致了阻塞性睡眠呼吸暂停，导致夜间睡眠憋气，这个情况可以考虑手术切除。另外，扁桃体肥大如果导致了说话不清晰，说话有含物音，这个情况也是要做扁桃体手术切除的适应证。如果扁桃体肥大堵塞咽腔，导致吞咽受阻挡，吞咽有不顺畅的感觉，此情况也是扁桃体切除的手术适应证。
如果是一侧扁桃体肥大，当然这一般是指成人，一侧扁桃体比另外一侧极度肥大。此情况要小心扁桃体肿瘤的存在，必要时要考虑做扁桃体的活检，做病理检查来明确诊断，排除肿瘤的可能性。
对于孩子的扁桃体肥大，常见有可能合并腺样体肥大，因为两者都属于咽部的淋巴组织。如果扁桃体腺样体肥大，导致了孩子的阻塞性睡眠呼吸暂停，必要时要通过手术切除扁桃体和腺样体，才能彻底解决夜间睡眠憋气、缺氧的问题，从而不耽误孩子的生长发育，促进孩子的生长发育。
