骨不连最好的治疗方法主要通过病因进行治疗，要找出造成骨不连的主要原因，这样才能够去除病因，并且通过其他的方法促进骨折的愈合，从而使肢体的功能逐渐的恢复。

骨不连常见的原因包括局部的原因，还有全身性的原因，局部的原因常常是感染，慢性骨髓炎造成了骨不连。由于骨折部位缺少血运，也可能造成了骨折生长缓慢，从而出现骨折不愈合，一般超过8个月的骨折不愈合，叫做骨不连。

所以要在手术的时候爱护软组织，避免进一步损伤骨折部位的血运，从而为骨折愈合提供更好的营养。也应该注意去除感染因素，避免慢性骨髓炎的出现，要及时的进行清创，使骨折断端新鲜化，使软组织的炎症逐渐的消失，从而为再次手术提供更好的环境。

如果是全身性因素造成的骨不连，应该注意避免营养不良，避免低蛋白血症，或者使用免疫抑制剂像糖皮质激素等，也可能造成骨不连甚至是骨坏死。所以骨不连要去除病因，通过二次手术，可以使骨折断端进行自体植骨，或者是异体骨的植骨，这样就可以使骨折断端稳定，通过这种植骨，能够达到很好的愈合。