甲胎蛋白持续升高，并且达到30000μg/L时，患者要先明确导致甲胎蛋白的疾病，比如活动性的肝炎、原发性的肝癌、畸胎瘤以及妇科的肿瘤等，但甲胎蛋升高的数值与严重程度无密切联系，即并非甲胎蛋白越高病情越重。

最常见引起甲胎蛋白升高的原因是活动性肝炎，如果患者感染乙肝病毒后处于病毒的复制活跃期，造成肝功能损害，可以通过病毒的滴度检查发现。还可以加上肝功能检查，转氨酶、胆红素的检查，明确后便要进行抗病毒以及护肝治疗，可以使甲胎蛋白下降。

还有可能是原发性肝癌引起的甲胎蛋白升高，此时若通过CT或核磁共振检查发现有肝脏的占位性病变，需及早通过手术治疗切除病变。此外，畸胎瘤或妇科肿瘤也可以引起甲胎蛋白升高，也可以通过手术切除病变，而后异常的甲胎蛋白便可以恢复到正常水平。