女性在月经期肚子疼的原因主要有以下两种：

1、痛经：尤其是年轻的女性，在来月经前后不注意休息、爱熬夜，而且爱吃生冷、刺激的食物，还比较贪凉，会导致来月经的时候经血排出不畅，而引起肚子疼。所以建议女性在来月经前要注意休息，少吃生冷、刺激的食物，不要贪凉，这样就会缓解月经期肚子疼的症状；

2、疾病：例如比较常见的慢性盆腔炎，慢性盆腔炎在来月经的时候，由于盆腔的充血会加重炎症的症状，就会导致经期肚子疼。此外还有比较常见的子宫内膜异位症，包括卵巢的巧克力囊肿、子宫肌腺症等，这些都会引起经期的肚子疼，而且肚子疼典型的症状是进行性加重，所谓进行性加重就是来一次月经腹痛加重一次。

总之，女性经期肚子疼应该到医院检查，明确诊断后，从而给予对症治疗。