大便酸臭味，通常考虑有消化不良，常与进食的东西有关，如之前有暴饮暴食，进食过于油腻、不易消化的食物，进食过冷、过热、过咸的食物，超出胃肠道消化能力而出现症状。其它疾病亦可导致大便酸臭味，如慢性胃病、胃溃疡、慢性胰腺炎、胆道系统疾病、功能性消化不良、炎症性肠病、肠道菌群紊乱、结肠癌等。
可能是一次大量进食或进食不易消化食物，导致消化酶分泌相对不足，食物不能充分消化吸收，且停留在胃肠道内存留的时间过长，导致肠道菌群紊乱，产气杆菌或腐败菌增多。食物残渣在肠道中腐败菌的分解作用下分解发酵，产生大量腐败气体，患者可出现胀气、排气增多、打嗝，以及排过酸、过臭的气味等临床表现。
故平时饮食上应注意避免一次性进食大量不易消化的食物，如大鱼、大肉，同时应减少辛辣、刺激性食物的摄入，避免胃肠道黏膜受刺激，导致胃肠道消化及运动功能失常，从而引起肠内异常发酵。还可服用多酶片、健胃消食片、得每通(胰酶肠溶胶囊)、双歧杆菌、乳杆菌、布拉氏酵母菌等，从而调节消化功能及肠道菌群，有助于减轻症状。
