目前约16-40周胎儿可进行胎儿心脏超声心动图检查，但最合适的孕周为孕前20-24周。早孕期胎儿体积比较小，心脏发育不完全，心脏切面显示不清楚，而晚孕期，胎儿骨骼发育，身影会遮挡心脏，还有胎儿体位、羊水等也会影响心脏超声显示，因此选择20-24周检查，但具体选择时机要根据实际情况决定。随超声预期改进，以及早孕期超声诊断技术的进步和应用，胎儿心脏超声可检查出严重畸形，从中孕期可提前到早孕期11-13周+6天进行。

此外，某些胎儿心脏畸形是动态形成，所以需动态检查，在20-24周有可能显示为正常心脏，而随孕周增大而出现异常，如部分肺动脉瓣或主动脉瓣狭窄、心脏肿瘤、心肌病等。若产科超声筛查发现胎儿心脏异常，有条件时应尽快安排胎儿超声心动图检查。中孕期胎儿超声心动图检查未发现明显异常，但若晚孕期出现左右心不对称，三尖瓣反流，应观察动脉导管有无收缩或早闭，卵圆孔有无血流受限或早闭。总之，检查时机无早晚，医生通常会根据需要为孕妇选择最佳检查时机。