女人做试管后，没有较大副作用，而且对女性卵巢功能等各个方面也没有较大影响。其副作用与所有手术一样均有一定风险，常见风险是多卵泡同时发育取卵后，雌激素水平升高，可能会出现卵巢过度刺激，但是现在促排卵药物、促排卵方案改进以后，卵巢过度刺激风险也降至较低，只要不做新鲜周期移植，风险几乎为0。另外，穿刺可能会带来风险，如穿刺后出现腹腔内出血、感染等，但是属于小手术，出现出血、感染风险极低。
试管属于极微创的手术，穿刺针通过阴道壁在B超监测下取卵，而且不是将月经周期所有卵子都取出来。1个月经周期有较多卵泡，在发育过程中，优势卵泡会把其他卵泡消灭掉，而在做试管时，要将1个月经周期的卵泡全部取出，不会导致女性提前绝经。如果取1-2次卵，取的都是当月卵，数量较多是因为使用了超速排卵的药物。
