病毒性肺炎的病因最主要是病毒的感染，比较常见的上呼吸道的病毒，像流感病毒主要包括甲型和乙型病毒，还有副流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒，以及冠状病毒、巨细胞病毒。也包括水痘-带状疱疹病毒，还有一些肠道的病毒，如柯萨奇病毒、埃可病毒。2003年的非典型肺炎也是由冠状病毒感染引起的，因此病毒性肺炎需引起广泛重视。