骨髓移植最大的问题是移植后并发症的处理。移植后的并发症有很多种类型，常见主要有移植物抗宿主病，即排异反应，间质性肺炎，出血性膀胱炎，包括感染等并发症。在排异反应的并发症里又表现为常见的三种类型，即皮肤与黏膜的排异，消化系统肠道排异，肝脏的排异。如果一旦出现消化系统肠道的排异之后，可能会产生大量腹泻。这时病人疼痛非常明显，腹泻量也非常大。所以肠道排异移植物抗宿主病中常出现的情况。对于肠道排异要积极抗排异，同时要补充液体，采用各种止泻措施，同时加强护理。肠道排异出现腹痛，积极进行止痛治疗，必须及早诊断，及早治疗。早期识别存在肠道排异的可能性，早期诊断治疗，可以减轻患者痛苦。
