小儿慢性结肠炎的治疗药物包括：

1、细菌性结肠炎：多使用抗生素，可通过大便细菌培养选择敏感的抗生素；

2、非细菌感染结肠炎，若由牛奶蛋白等食物过敏引起，可以停掉过敏食物；

3、抗生素相关性肠炎，要停用一般的抗生素，可通过补充益生菌治疗；

4、溃疡性结肠炎要正规治疗溃结，可用磺胺类药物，美沙拉嗪等柳氮磺类药物，严重时可用激素，还可进行饮食治疗。

具体用药请结合临床，由医生面诊指导为准。