引起骶管囊肿的原因比较复杂，但最基本的有两条因素：

1、病人硬膜囊末端分出神经根的部位存在先天性薄弱，导致形成后天囊肿；

2、由于人类的直立行走行为，导致脑脊液压力传导到骶尾端，骶尾端压力过大，随着时间推移，囊肿逐步增大。