口腔溃疡的治疗主要分为诊室的治疗及回家后的护理。诊室治疗主要是双氧水和生理盐水交替冲洗，洗掉溃疡表面的食物残渣及菌斑，之后使用碘甘油或相应的治疗药物，以减轻溃疡疼痛。回家后的护理需患者保持口腔卫生，饭后漱口、刷牙，减少菌斑，有利于溃疡的愈合，延长溃疡的静止期，避免溃疡在短时间内不再复发。