肛瘘属于肛肠科多发病、常见病，部分久治不愈的肛瘘可形成癌变。大部分肛瘘患者认为病情较轻，若无不适症状，不愿到医院检查治疗。若不及时治疗肛瘘，瘘管越来越复杂，治疗更加困难，从而可能会影响到肛门正常生理功能。形成肛瘘几乎不可能自愈，需要及时行手术治疗。由于特殊原因不能手术或不愿手术，带瘘生存患者需要注意局部检查或临床症状变化，定期进行影像学检查，必要时可以取组织活检。癌灶在瘘管深部需要多次深部病灶活检，有利于减少漏诊，同时还要提高患者对此病的思想认识。
目前肛瘘癌变确诊原因和机制，多数研究认为肛瘘反复炎症刺激使炎性细胞增生，进而引起细胞变异发生癌变。肛瘘癌变还可能与免疫功能降低有关，慢性肛瘘癌变由于早期诊断率较低，发现时多为中晚期，但肛瘘癌变病灶相对局限，发展慢、恶性程度低，经积极治疗后预后相对较好。
