双眼皮手术不同的方法会出现不同的并发症。埋线法的后遗症有伤口感染、线头排异及后期脱落；三点小切口法，也有脱落的可能性，但比埋线更持久；全切法的并发症有短期出血、后期感染、上睑下垂、双侧眼睛不对称等。切开手术或者埋线手术都有可能造成双侧眼睛不对称，医生在术前需检查患者肌力是否平衡，做好术前设计。