由于小儿处于生长发育的时期，随着免疫功能的完善，小儿肛瘘有自愈的倾向，小儿肛瘘不必要急于手术治疗。一般情况下在两岁以内的小儿肛瘘基本上都能自愈，但是两岁以上出现的肛瘘也可以根据病情暂时观察。一般建议是等到学龄期，也就是6-8岁之后，可以进行手术的治疗。