志贺杆菌也称志贺菌，其感染引起的痢疾，主要应用抗菌药物治疗。如果腹痛明显，可以应用解痉药物，排便次数多也可以补水治疗。抗菌药物首选喹诺酮类药物，比如可以应用环丙沙星、诺氟沙星、左氧氟沙星。

如果患者不能应用喹诺酮类的药物，比如儿童，也可以选择头孢类的药物，一般选择二代头孢，也可以应用三代头孢。对于能够口服的患者，尽可能口服治疗，对于不能够口服的患者，也可以应用静脉的抗菌药物治疗。

对于志贺菌引起的痢疾，一般不主张应用止泻剂。志贺菌引起的痢疾一般排便次数比较多，主要是黏液，或者局部渗出的脓血，很少有粪质。这些毒素以及炎症渗出不主张应用止泻剂，否则不利于细菌以及毒素的排出。

如果患者有明显腹痛，可以应用解痉挛的药物，比如654-2即消旋山莨菪碱或者颠茄片。对于志贺菌引起的痢疾，通常引起脱水的情况不是很多见，但也要注意，如果患者排便次数非常多，尽量多补充水分，还可以补充盐分。

最好选择口服补液盐，既可以补水，也可以补充盐分。对于痢疾杆菌的感染者，应该采用足够疗程抗感染治疗，否则也可以引起慢性菌痢。