巨细胞病毒的感染是否严重，取决于病人本身的免疫状态。如果免疫状态较好、免疫功能正常的人感染巨细胞病毒，不会有太大问题。若是免疫功能较差的人被巨细胞病毒感染，可能会成为致命的问题。
对于免疫功能正常的人而言，当病毒进到体内时，免疫系统可以把病毒及时把病毒清除掉。人体免疫系统好时，甚至无明显感觉，没有明显的不舒服。可能相对而言，部分患者会有轻微发烧、嗓子疼、淋巴结的肿大、颈部出现包块等，个别患者可能有肺炎、肝炎、转氨酶高等情况，但都为自限性，会自行好转。而对于免疫功能不好的患者而言，巨细胞病毒感染就可能会造成严重影响。巨细胞病毒会影响脑部导致脑炎，也可能导致眼睛的病变，引发视力下降甚至失明，还可能导致严重肝炎、肺炎、肠炎等。总而言之，免疫功能的好坏，决定被巨细胞病毒感染后的不同临床结局。
