智齿是人类最后萌出的一颗牙齿，正常情况下生长在上下牙列的最后端，上下左右各一颗，一共4颗，因为萌出比较晚，通常在成年人以后，身体发育、颌骨发育已经完成后萌出，因为没有正常的位置，所以会出现生长的位置不正，专业角度将其称为阻生牙，甚至出现倒置。正常的自然牙齿存在自洁功能，如食用纤维性的蔬菜，包括韭菜、芹菜或笋干，在咀嚼的时候会有自洁功能，可类似于钢丝球一样将牙齿周围的色素或菌斑擦掉。但因为智齿位置不当，没有正常的咬合关系，因此在绝大多数情况下很容易形成菌斑沉积。
而菌斑沉积下来以后，如果完全包埋在骨头里不存在、也看不见发黑，如果萌出以后，菌斑沉积以后，色素沉积或蛀牙都有可能会造成发黑的情况。因为没有自洁功能，发生率很高，有时是色素沉着，有时只是发育伤或其它颜色改变。蛀牙其实是龋洞形成，探针能探得进去能够勾住形成的洞才可称为蛀牙，并不能完全单凭表面发黑即诊断为蛀牙。