腋窝的皮下囊肿和淋巴结是完全两个不同的疾病，其区别如下：

1、部位来源：皮下囊肿是来自于皮肤的囊性肿物，称为皮下囊肿或皮脂腺囊肿，是皮肤局部皮脂腺分泌障碍导致的局部潴留性囊肿，完全在皮肤上，检查时可以在腋窝上摸到，沿着皮肤推动皮肤，肿物会跟皮肤一起运动，呈囊性，在局部囊肿表面可以看到黑色小点，此处为皮肤毛囊皮脂腺分泌的地方。腋窝是淋巴结比较常见的肿大部位，淋巴结在皮下，在皮肤深层组织里，腋窝淋巴结位置更深，有些在腋下位置，在更深的位置，淋巴结是实性肿物，边界相对比较清晰，是活动度比较大的肿物；

2、症状表现：皮下囊肿有时会伴有感染，会有局部的肿大、红肿、疼痛，甚至流脓的表现。而淋巴结在碰触时，有些淋巴结肿大的患者会有疼痛，主要是腋窝淋巴结的疼痛是因为淋巴结炎造成，局部有淋巴结需要进一步鉴别，可以通过超声，超声可以判断到底是皮下囊肿还是淋巴结，因为一个是实性，一个是囊性，具体部位也不一样，通过影像学可以容易鉴别。